Die seit 1865 kontinuierlich gewachsene Lehrsammlung des Instituts für Spezielle Zoologie enthält über 1500 makroskopische und ca. 20.000 mikroskopische Einzelpräparate. Diese werden intensiv genutzt für die Ausbildung angehender Biologen, Mediziner, Ernährungswissenschaftler und Bioinformatiker. Seit Bestehen der Sammlung orientieren sich die Präparate immer auch an den sich wandelnden Fragestellungen im Fach Zoologie. Präparate der Sammlung, die in Lehre nur noch selten genutzt werden, können aber auch neue Quellen zur Geschichte der Zoologie und ihrer Vermittlung eröffnen. Dazu zählt z.B. eine Sammlung mit über hundert Wachsmodellobjekten aus dem seit Mitte des 19. Jahrhunderts bestehenden Atelier für Wissenschaftliche Plastik von Adolf und Friedrich Ziegler/Freiburg Br. Ergänzt wird der Bestand der Sammlung durch rund 350 Wandkarten bedeutender Illustratoren, darunter Pfurtscheller und Leuckart.